Biscayne Bay abarca 428 millas cuadradas de aguas protegidas entre el horizonte del centro de Miami y los arrecifes de coral del Parque Nacional Biscayne.
La bahía alcanza profundidades de solo doce pies en la mayoría de las áreas, creando las aguas poco profundas de color turquesa que definen el paisaje marino del sur de Florida. El Congreso estableció el parque nacional en 1980 para preservar los cayos más septentrionales y los lechos de pastos marinos de la bahía, que sirven de sustento a manatíes, tortugas marinas y poblaciones de peces juveniles.
Los chárteres privados con capitán navegan por estas aguas bajo normativas federales y estatales que restringen la velocidad de las embarcaciones cerca de las zonas designadas para manatíes y limitan el anclaje sobre coral vivo. Los capitanes con licencia poseen credenciales de la Guardia Costera de los Estados Unidos y mantienen conocimientos sobre bancos de arena cambiantes, marcas de canal y patrones meteorológicos que cambian cada hora en condiciones subtropicales. La costa occidental de la bahía recorre un tramo de quince millas de propiedades frente al mar en Star Island, Palm Island y Hibiscus Island, donde el valor de las propiedades supera los treinta millones de dólares por parcela. Los estilos arquitectónicos van desde el Renacimiento Mediterráneo de los años 20 hasta torres de cristal contemporáneas diseñadas por Arquitectonica y otras firmas con sede en Miami.
Un tour privado en barco por Miami con capitán suele salir de los puertos deportivos cerca de Bayside Marketplace o Miami Beach Marina, siguiendo los canales marcados hacia el sur, hacia Stiltsville, o hacia el norte, pasando las terminales de cruceros del Puerto de Miami. Las siete casas de madera que quedan en Stiltsville se alzan sobre pilotes a dos millas de la costa, restos de un asentamiento de pesca y juego que alcanzó un máximo de veintisiete estructuras antes de que el huracán Betsy destruyera la mayoría en 1965. El Servicio de Parques Nacionales mantiene ahora las casas como monumentos históricos. Los capitanes a menudo apagan los motores cerca de los pilotes para explicar la historia de contrabando del lugar y señalar a los cormoranes y pelícanos pardos que anidan en las vigas desgastadas.
Los chárteres en Biscayne Bay operan durante todo el año, aunque las tormentas de verano se forman rápidamente entre junio y septiembre, lo que a menudo requiere ajustes de ruta. Los meses de invierno traen cielos más despejados y mares más tranquilos, con temperaturas del agua que bajan a setenta grados Fahrenheit. La bahía sirve como laboratorio natural para programas de ciencias marinas en la Rosenstiel School de la Universidad de Miami, donde los investigadores monitorean los niveles de salinidad, la salud de los pastos marinos y los efectos de la escorrentía urbana en los ecosistemas de arrecifes.
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