Biscayne Bay s'étend sur 428 miles carrés d'eaux protégées entre la skyline du centre-ville de Miami et les récifs coralliens du parc national de Biscayne.
La baie atteint une profondeur de seulement douze pieds dans la plupart des zones, créant les hauts-fonds turquoise qui définissent le paysage marin du sud de la Floride. Le Congrès a créé le parc national en 1980 pour préserver les cayes les plus septentrionales et les herbiers marins de la baie, qui abritent des lamantins, des tortues marines et des populations de poissons juvéniles.
Les chartes privées avec capitaine naviguent dans ces eaux conformément aux réglementations fédérales et étatiques qui limitent la vitesse des navires à proximité des zones désignées pour les lamantins et restreignent le mouillage sur le corail vivant. Les capitaines brevetés possèdent des accréditations de l'United States Coast Guard et connaissent bien les bancs de sable mouvants, les balises de chenal et les conditions météorologiques qui changent toutes les heures dans cet environnement subtropical. La rive ouest de la baie longe une étendue de quinze miles de propriétés riveraines sur Star Island, Palm Island et Hibiscus Island, où la valeur des propriétés dépasse trente millions de dollars par parcelle. Les styles architecturaux vont du renouveau méditerranéen des années 1920 aux tours de verre contemporaines conçues par Arquitectonica et d'autres cabinets basés à Miami.
Une excursion privée en bateau à Miami avec capitaine part généralement des marinas proches de Bayside Marketplace ou de la Miami Beach Marina, suivant les chenaux balisés vers le sud en direction de Stiltsville ou vers le nord après les terminaux de croisière du port de Miami. Les sept maisons en bois restantes de Stiltsville reposent sur des pilotis à deux miles au large, vestiges d'une colonie de pêcheurs et de joueurs qui comptait vingt-sept structures avant que l'ouragan Betsy n'en détruise la majeure partie en 1965. Le National Park Service entretient désormais les maisons en tant que monuments historiques. Les capitaines laissent souvent les moteurs tourner au ralenti près des pilotis pour expliquer l'histoire de la contrebande sur le site et montrer les cormorans et les pélicans bruns qui nichent sur les poutres usées par le temps.
Les chartes de Biscayne Bay opèrent toute l'année, bien que des orages estivaux se forment rapidement entre juin et septembre, nécessitant souvent des ajustements d'itinéraire. Les mois d'hiver apportent un ciel plus clair et des mers plus calmes, avec des températures de l'eau tombant à soixante-dix degrés Fahrenheit. La baie sert de laboratoire naturel pour les programmes de sciences marines de la Rosenstiel School de l'Université de Miami, où les chercheurs surveillent les niveaux de salinité, la santé des herbiers marins et les effets du ruissellement urbain sur les écosystèmes récifaux.
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